Die Struktur jeder Datenbank ist in einer Reihe von Systemtabellen beschrieben. Systemtabellen gehören dem SYS-Benutzer. Der Inhalt dieser Tabellen kann nur durch den Datenbankserver geändert werden. Die Befehle UPDATE, DELETE und INSERT können nicht zum Ändern des Inhalts dieser Tabellen verwendet werden. Außerdem kann die Struktur dieser Tabellen nicht mithilfe der Anweisungen ALTER TABLE und DROP verändert werden.

Systemtabellen in SQL Anywhere werden über ihre entsprechenden Ansichten zugänglich gemacht.